샌프란시스코에서 고질라의 공격에서 살아남은 케이트는 충격적인 비밀에 크게 동요한다. 무시무시한 위협 가운데 케이트는 가족과 ‘모나크’라는 비밀 조직의 비밀을 알아내기 위해 세계 곳곳으로 모험을 떠난다.